快速建置伺服器虛擬化環境，是超融合基礎架構的強項，但實際應用上並不僅止於此，許多廠商會進一步延伸到VDI、桌面虛擬化應用的領域，對Nutanix來說，他們有不少產品導入案例，就是用於桌面虛擬化環境當中，而在2016年，該公司親自跨足到這個領域，宣布與Citrix合作，共同推出了Nutanix InstantON VDI for Citrix的解決方案。 這套整合方案下，適合用於3百人到數千人規模的中大型企業，導入之後，號稱能大幅簡化VDI環境的建置工作，希望能降低部署時所面臨的失敗風險。
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